莱顿大学为欧洲学术声誉最高的综合性大学之一。秉承“自由之棱堡”的校训，她是欧洲最早实践宗教和信仰自由的大学之一。其开放包容的治校精神，从荷兰黄金时代时代以来，吸引了无数顶尖国际学者慕名前往，在自由学术环境下潜心治学，让其一度成为欧洲科学人文中心。“近代科学始祖”笛卡尔，在莱顿大学访学期间完成发表《第一哲学沉思录》；“欧洲最伟大艺术家之一”伦勃朗在莱顿年代，突破油画艺术史上里程碑式的光线技术（light and variety of paint application）；爱因斯坦在莱顿大学长达近二十年的客座教授期间，留下了《玻色-爱因斯坦凝聚态》等研究手稿。

全球高校千年排名将莱顿大学位列全球名校第29位，名列17世纪荷兰黄金时代(Dutch Golden Age)世界名校第4位。2013年《泰晤士高等教育世界大学排名》(Times Higher Education’s World University Rankings) 给出的排名中，莱顿大学的全球综合排名位列第64位，为荷兰排名最高的大学。此外，几乎历年《泰晤士高等教育世界大学排名》(Times Higher Education’s World University Rankings) 给出的人文科学专业(Arts and Humanities)排名中，莱顿大学均排名欧洲大陆第1位(Continental Europe Ranking No. 1)。根据2014年《QS世界大学排名》，莱顿多个学科领域排名世界顶尖。其中法学排名全球23位，语言学26位，历史和考古学28位，政治学与国际关系学第34位，医学第36位。在2015－2016年《泰晤士高等教育世界大学排名》中，人文学科排名位列世界第17位，再次名列欧洲大陆高校排行榜首。

莱顿大学是科英布拉集团的创立成员之一 (即Coimbra Group，简称CG，是由39所欧洲最古老且富盛望的精英大学组成的集团），同时也是Europaeum（欧洲10所知名大学联合体）和League of European Research Universities （欧洲顶尖研究型大学联盟）的创立成员。
莱顿是一座典型的大学城，大学各学院遍布全莱顿城，莱顿大学的莘莘学子也让莱顿这座古典美丽的欧洲小城的气氛更加轻松而充满活力。日本著名的俳句作者蒲原宏曾咏叹：“莱顿大学城，月色凉如冰”。诗中所提到的这个大学是荷兰最古老的大学，这里也是著名画家伦勃朗的出生地。

在欧洲，莱顿与牛津堪称双子，前者是欧洲大陆声望及学术地位最高的大学所在地，后者是英格兰最古老的大学——牛津大学所在地。每年牛津和莱顿都会有定期的官方交流活动。

院系设置

莱顿大学没有中央校园；所有建筑散布在城市各处。有些建筑年代非常久远，例如Gravensteen (现为莱顿的国际办公室)；如Lipsius以及Gorlaeus。
莱顿大学共分为7大学院(截至2015年)[13]  ，50多个系所，150多个专业与超过100个以上的研究所：
考古学院（Faculty of Archaeology）；
海牙校区（Faculty Campus The Hague）；
人文学院（Humanities）；
法学院（Leiden Law School）；
莱顿医学中心（Leiden University Medical Center）；
科学院（Faculty of Science）；
社会学与行为科学学院（Faculty of Social and Behavioural Sciences）；
其他学院：
莱顿大学学院—海牙（Leiden University College The Hague）；
教育学院（School of Education）；
创作及表演艺术学院是由莱顿大学、Royal Conservatory以及Royal Academy for Art合作创建的。该大学没有经济学、商学与管理学院。然而，2002年创立了莱顿管理学校(LUSM)，提供6个专业MBA课程。此课程只维持四年，也就是2006年所有管理课程都被取消。然而莱顿管理学校发展了其他商业管理活动，使得他们与大学内的学院关系更密切。他们与数学学院合作提供理学硕士学位：商业信息通信技术专业。